نویسندگان | بهزاد حاجی اقراری، مجاهد کمالی¬زاده، ناصر فرخی |
---|---|
همایش | چهارمین همایش بینالمللی و دوازدهمین کنگره ملی بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران |
تاریخ برگزاری همایش | 1400/05/31 - 1400/06/02 |
نوع ارائه | چاپ در مجموعه مقالات |
سطح همایش | بین المللی |
چکیده مقاله
خلاصه
انتقال افقی به طور طبیعی در مورد توالی های نوکلئوتیدی، ژنها وترانسپوزونها بین گونههایی که از نظر تکاملی فاصله زیادی باهم دارند،توسط مکانیسمهای شناخته شده اتفاق میافتد. در تحقیق حاضر، با در نظر گرفتن لیست ژنهای میکروآرانای هر گونه و اجداد آنها در دو مسیرهای تکاملی تکنیای گیاهان گلدار تک لپه ای و دو لپه ای، انتقال افقی ژنهای میکروآرانای در 18 گونه گیاهی مختلف مورد مطالعه قرار گرفت. از شیوه آنالیز به روش بیشترین پارسیمونیدولو برای بررسی روند ایجاد و از بین رفتن خانوادههای ژنی میکروآرانای در درخت فیلوژنتیکی ترسیم شده برای گونه های تک لپه ای و دو لپه ای به صورت مجزا استفاده شد. سپس لیست خانوادههای ژنی میکروآرانای برای اجداد گونهها در سطوح مختلف به دست آمد. خانواده های میکروآرانای که در اجدادشان مشاهده نشد اما در لیست گونهها و اجداد گونههای غیر مرتبط وجود داشتند مورد توجه قرار گرفتند. توالی پیشساز آنها به منظور مشاهده شباهت بین ترکیب توالیها مورد توجه قرار گرفت. در این مطالعه 21 خانواده میکروآرانای که بین گونه های تکلپهای و دولپهای مشترک بودند اما در اجداد آنها پس از اشتقاق از جد مشترکشان غایب بودند شناسایی شد. با توجه به اینکه این گونه های تکلپهای و دولپهای به صورت تکنیا در نظر گرفته میشوند و به دلیل شباهت زیاد توالیهای پیشساز آنها انتقال افقی ژن بین این گونهها مفروض است. این نوع انتقال ممکن است به صورت مستقیم از یک گیاه به گیاه دیگر به عنوان مثال با پیوند و/یا به کمک ناقلینی مانند ویروس انجام شود. همانطور که در مورد انتقال ژنهای کد کننده پروتئین اتفاق میافتد.
کلمات کلیدی: بیشینه پارسیمونی دولو، دولپهای ها، تکلپهای ها، انتقال افقی ژن، ژن میکروآرانای