انتقال افقی ژن¬هاي میکروآران¬ای بین گونه¬های متعلق به دو مسیر اصلی تکاملی تک¬نیا در گياهان

نویسندگانبهزاد حاجی اقراری، مجاهد کمالی¬زاده، ناصر فرخی
همایشچهارمین همایش بین‌المللی و دوازدهمین کنگره ملی بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران
تاریخ برگزاری همایش1400/05/31 - 1400/06/02
نوع ارائهچاپ در مجموعه مقالات
سطح همایشبین المللی

چکیده مقاله

خلاصه

انتقال افقی به طور طبیعی در مورد توالی های نوکلئوتیدی، ژن­ها وترانسپوزون­ها بین گونه­هایی که از نظر تکاملی فاصله زیادی باهم دارند،توسط مکانیسم­های شناخته شده­ اتفاق می­افتد. در تحقیق حاضر، با در نظر گرفتن لیست ژن­های میکروآران­ای هر گونه و اجداد آنها در دو مسیرهای تکاملی تک­نیای گیاهان گلدار تک لپه ای و دو لپه ای، انتقال افقی ژن­های میکروآران­ای در 18 گونه گیاهی مختلف مورد مطالعه قرار گرفت. از شیوه آنالیز به روش بیشترین پارسیمونی­دولو برای بررسی روند ایجاد و از بین رفتن خانواده‌های ژنی میکروآران­ای در درخت فیلوژنتیکی ترسیم شده برای گونه های تک لپه ای و دو لپه ای به صورت مجزا استفاده شد. سپس لیست خانواده­های ژنی میکروآران­ای برای اجداد گونه­ها در سطوح مختلف به دست آمد. خانواده های میکروآران­ای که در اجدادشان مشاهده نشد اما در لیست گونه­ها و اجداد گونه­های غیر مرتبط وجود داشتند مورد توجه قرار گرفتند. توالی پیش­ساز آنها به منظور مشاهده شباهت بین ترکیب توالی­ها مورد توجه قرار گرفت. در این مطالعه 21 خانواده میکروآران­ای که بین گونه های تک­لپه­ای و دولپه­ای مشترک بودند اما در اجداد آنها پس از اشتقاق از جد مشترکشان غایب بودند شناسایی شد. با توجه به اینکه این گونه های تک­لپه­ای و دولپه­ای به صورت تک­نیا در نظر گرفته می­شوند و به دلیل شباهت زیاد توالی­های پیش­ساز آنها انتقال افقی ژن بین این گونه­ها مفروض است. این نوع انتقال ممکن است به صورت مستقیم از یک گیاه به گیاه دیگر به عنوان مثال با پیوند و/یا به کمک ناقلینی مانند ویروس­ انجام شود. همانطور که در مورد انتقال ژن­های کد کننده پروتئین اتفاق می­افتد.

کلمات کلیدی: بیشینه پارسیمونی دولو، دولپه­ای ها، تک­لپه­ای ها، انتقال افقی ژن، ژن میکروآران­ای

لینک ثابت مقاله